Le GIP assure, par son pôle scientifique, la maîtrise d’ouvrage des actions de recherche du programme Seine Aval et par son pôle opérationnel, la maîtrise d’ouvrage des applications de la recherche et le transfert des résultats de cette recherche.

Le GIP est appelé à contribuer à la réflexion engagée dans le cadre du Plan de Gestion Globale de l’Estuaire de la Seine à qui il apportera son expertise et son savoir-faire opérationnel.

Les limites géographiques du GIP, sont fixées :

• à l’amont : par le barrage de Poses, le programme PIREN Seine étant chargé des problématiques en amont du bassin ;
• à l’aval : au tiers oriental de la Baie de Seine, soit la zone comprise au sud d’un parallèle passant à Antifer et à l’est d’un méridien passant à Ouistreham ;
• et incluent pour l’emprise latérale : tous les bassins versants internes au système estuarien et leurs milieux associés (zones connexes : vasières, zones humides, zones de confluence des affluents de l'estuaire interne).

Certaines actions nécessitant d’étendre d’une façon importante les limites des recherches entreprises pourront être néanmoins considérées, dans la mesure où les phénomènes étudiés auraient pour origine l'estuaire de la Seine.

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